Первое появление Гайдена Кристенсена на экране произошло в 12 лет. Он дебютировал в канадском телесериале «Семейные страсти». Немного позже актер отметился в сериале «Higher Ground» канала Fox Family Channel.

Впервые критики обратили внимание на актера после выхода драмы Ирвина Уинклера «Жизнь как дом», в которой Гайден Кристенсен сыграл тинэйджера. Кроме внимания, эта роль принесла номинацию от гильдии киноактеров, награду Национального совета критиков «За выдающееся исполнение», а также номинацию на «Золотой глобус».

Однако звездный час Гайдена Кристенсена настал после съемок в фильме Джорджа Лукаса «Звездные войны. Эпизод II: Атака клонов», где актер сыграл Анакина Скауолкера. Пополнили фильмографию актера и такие фильмы как «Девственницы-самоубийцы» Софии Копполы, «Фабричная Девушка» Джорджа Хикенлупера, «Jumper» Дага Лаймана, «Нью-Йорк, я люблю тебя» и другие.

В 2005 году Кристенсен снялся в блокбастере «Звездные войны. Эпизод III: Месть Ситхов». Первым фильмом, который при поддержке партнеров, спродюсировала продюсерская компания Кристенсена Гайдена Forest Park Pictures стал «Афера Стивена Гласса» (Shattered Glass).